87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00630 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  100 
 
 
76 aa  154  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  52.78 
 
 
78 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2599  prevent-host-death family protein  44.16 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143583  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2443  prevent-host-death family protein  45.95 
 
 
83 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0810105  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3738  prevent-host-death family protein  45.95 
 
 
77 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  45.07 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  43.06 
 
 
79 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1037  prevent-host-death family protein  45.95 
 
 
77 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1429  prevent-host-death family protein  41.1 
 
 
81 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  45.21 
 
 
93 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  41.33 
 
 
78 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0065  prevent-host-death family protein  50.77 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0024  prevent-host-death protein  50.77 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0046  prevent-host-death family protein  50.77 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.41963  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0206  prevent-host-death family protein  50.94 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581637  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3677  prevent-host-death family protein  44.12 
 
 
81 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763489  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2530  prevent-host-death family protein  43.42 
 
 
80 aa  57.4  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  53.85 
 
 
73 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4693  prevent-host-death family protein  41.33 
 
 
80 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.490167 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  40 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1572  prevent host death protein  44.3 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677398  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3368  prevent-host-death family protein  41.03 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4124  prevent-host-death family protein  42.42 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167501  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  36.76 
 
 
81 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2423  prevent-host-death protein  38.96 
 
 
82 aa  55.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0775  prevent-host-death protein  40.54 
 
 
79 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99719  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2910  prevent-host-death family protein  52.73 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.293709  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  54.35 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  38.57 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3631  prevent-host-death family protein  45 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1566  prevent-host-death family protein  45.31 
 
 
75 aa  54.3  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.814372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6300  hypothetical protein  41.1 
 
 
102 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4538  prevent-host-death family protein  40.32 
 
 
82 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5349  prevent-host-death family protein  53.49 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5378  prevent-host-death family protein  45.16 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963401 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0707  prevent-host-death family protein  54.55 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2647  prevent-host-death family protein  54.55 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2969  prevent-host-death family protein  38.36 
 
 
75 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.686519 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2948  prevent-host-death family protein  38.36 
 
 
79 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183383  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2334  prevent-host-death protein  38.36 
 
 
79 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  36.84 
 
 
85 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0629  prevent-host-death family protein  54.55 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.285054  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0414  prevent host death protein  42.67 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0108  prevent-host-death family protein  57.5 
 
 
71 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0577  prevent-host-death family protein  42.67 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3825  prevent-host-death protein  54.55 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1996  prevent-host-death family protein  39.68 
 
 
75 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.374935  normal  0.0428431 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0655  prevent-host-death family protein  54.55 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2184  prevent-host-death family protein  35.62 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.415142  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0994  prevent-host-death protein  39.19 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1433  prevent-host-death protein  36.76 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.205341  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  50 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3329  prevent-host-death family protein  42.37 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2929  prevent-host-death family protein  47.73 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.106644 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3462  prevent-host-death protein  51.22 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.834225  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1093  prevent-host-death family protein  35.94 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245434  unclonable  0.0000000090615 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3716  prevent-host-death family protein  43.14 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0326037 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3686  prevent-host-death family protein  36.51 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4033  hypothetical protein  43.08 
 
 
76 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.69102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0766  prevent-host-death protein  38.71 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27663  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4667  prevent-host-death family protein  48.78 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.511085 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3784  hypothetical protein  55.88 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640007  decreased coverage  0.000191951 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2602  prevent-host-death family protein  43.48 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406254  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0199  prevent-host-death family protein  38.96 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172056  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2983  prevent-host-death family protein  54.29 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.413921  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4651  hypothetical protein  45.61 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2596  prevent-host-death family protein  54.29 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3455  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.825044 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2223  prevent-host-death family protein  33.78 
 
 
81 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0735  prevent-host-death family protein  48.65 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1782  prevent-host-death family protein  33.9 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3172  prevent-host-death family protein  47.5 
 
 
53 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0729417  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0187  prevent-host-death family protein  39.29 
 
 
75 aa  42.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3050  prevent-host-death family protein  43.18 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1318  prevent-host-death family protein  43.18 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.404403  normal  0.571647 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5801  prevent-host-death family protein  43.48 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.866899  normal  0.0690534 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5571  prevent-host-death family protein  28 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00661607  normal  0.119215 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4551  prevent-host-death family protein  40.91 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1777  prevent-host-death family protein  44.19 
 
 
83 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1948  prevent-host-death family protein  49.02 
 
 
78 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.861466  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3775  prevent-host-death family protein  50 
 
 
80 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1573  prevent-host-death family protein  40.68 
 
 
82 aa  41.2  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3886  prevent-host-death family protein  46.15 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0182  hypothetical protein  46.51 
 
 
58 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.443099  normal  0.495764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4044  prevent-host-death protein  30.67 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.104043  normal  0.215101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1698  prevent-host-death family protein  36.92 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.032948 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1704  prevent-host-death family protein  36.92 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.130638 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>