75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0206 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0206  prevent-host-death family protein  100 
 
 
76 aa  155  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581637  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3716  prevent-host-death family protein  66.22 
 
 
81 aa  104  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0326037 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  61.04 
 
 
76 aa  89  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  56.76 
 
 
73 aa  76.6  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3329  prevent-host-death family protein  55.41 
 
 
79 aa  76.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  53.33 
 
 
78 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  48.72 
 
 
78 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  50.68 
 
 
79 aa  71.6  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  51.35 
 
 
76 aa  70.1  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  48 
 
 
79 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1429  prevent-host-death family protein  50.67 
 
 
81 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  48.05 
 
 
81 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3677  prevent-host-death family protein  48.28 
 
 
81 aa  60.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763489  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  52.46 
 
 
95 aa  61.2  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2910  prevent-host-death family protein  39.73 
 
 
77 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.293709  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3631  prevent-host-death family protein  45.83 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  50.94 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2599  prevent-host-death family protein  40.58 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143583  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0108  prevent-host-death family protein  58.54 
 
 
71 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3738  prevent-host-death family protein  52.38 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4693  prevent-host-death family protein  45.76 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.490167 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2423  prevent-host-death protein  51.22 
 
 
82 aa  54.7  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2443  prevent-host-death family protein  37.68 
 
 
83 aa  53.9  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0810105  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1037  prevent-host-death family protein  43.75 
 
 
77 aa  53.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  46.55 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  40.26 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4124  prevent-host-death family protein  46.15 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167501  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1948  prevent-host-death family protein  46.84 
 
 
78 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.861466  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3784  hypothetical protein  58.54 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640007  decreased coverage  0.000191951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2939  prevent-host-death family protein  41.56 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100426  normal  0.275009 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5349  prevent-host-death family protein  54.35 
 
 
75 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2530  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1566  prevent-host-death family protein  40.28 
 
 
75 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.814372 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0065  prevent-host-death family protein  42.37 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2223  prevent-host-death family protein  53.06 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0046  prevent-host-death family protein  42.37 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.41963  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0024  prevent-host-death protein  42.37 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0414  prevent host death protein  41.38 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6300  hypothetical protein  41.89 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1573  prevent-host-death family protein  41.03 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6159  prevent-host-death family protein  56.41 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598446  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0577  prevent-host-death family protein  41.38 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4538  prevent-host-death family protein  44.64 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  44.64 
 
 
93 aa  47.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0994  prevent-host-death protein  42.11 
 
 
82 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3368  prevent-host-death family protein  47.5 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  55 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1572  prevent host death protein  37.84 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677398  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3775  prevent-host-death family protein  50 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0775  prevent-host-death protein  35.82 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99719  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2969  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.686519 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2948  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183383  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2334  prevent-host-death protein  41.67 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3232  prevent-host-death protein  35.21 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.527202  normal  0.0182559 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5571  prevent-host-death family protein  45.65 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00661607  normal  0.119215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3455  prevent-host-death family protein  48.89 
 
 
85 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.825044 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1777  prevent-host-death family protein  46.94 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4044  prevent-host-death protein  33.78 
 
 
78 aa  42.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.104043  normal  0.215101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1816  prevent-host-death family protein  44.23 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00000021208  hitchhiker  0.0000000000223341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4667  prevent-host-death family protein  45.65 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.511085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00390  hypothetical protein  44.9 
 
 
49 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.059073 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0199  prevent-host-death family protein  51.35 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172056  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0182  hypothetical protein  43.86 
 
 
58 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.443099  normal  0.495764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1406  prevent-host-death family protein  50 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.190407  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2038  prevent-host-death family protein  36.36 
 
 
85 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1315  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 
78 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147155  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3172  prevent-host-death family protein  52.63 
 
 
53 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0729417  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2596  prevent-host-death family protein  43.59 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2983  prevent-host-death family protein  43.59 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.413921  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2647  prevent-host-death family protein  46.34 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0735  prevent-host-death family protein  41.46 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2206  prevent-host-death protein  41.03 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.429062  normal  0.232261 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5378  prevent-host-death family protein  37.04 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963401 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4705  prevent-host-death family protein  45.24 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.087164  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2184  prevent-host-death family protein  29.85 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.415142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>