58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2530 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2530  prevent-host-death family protein  100 
 
 
80 aa  165  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3677  prevent-host-death family protein  63.29 
 
 
81 aa  103  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763489  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4693  prevent-host-death family protein  62.34 
 
 
80 aa  98.2  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.490167 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2423  prevent-host-death protein  58.02 
 
 
82 aa  94  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0065  prevent-host-death family protein  59.26 
 
 
82 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0024  prevent-host-death protein  59.26 
 
 
82 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0046  prevent-host-death family protein  59.26 
 
 
82 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.41963  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0994  prevent-host-death protein  50.63 
 
 
82 aa  87.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  53.25 
 
 
85 aa  87  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4538  prevent-host-death family protein  51.28 
 
 
82 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0775  prevent-host-death protein  51.28 
 
 
79 aa  84.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99719  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2184  prevent-host-death family protein  48.68 
 
 
85 aa  83.6  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.415142  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  48.68 
 
 
95 aa  79.3  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  50 
 
 
78 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  43.59 
 
 
76 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0199  prevent-host-death family protein  41.46 
 
 
85 aa  68.2  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  43.59 
 
 
79 aa  67  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1429  prevent-host-death family protein  41.77 
 
 
81 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  43.59 
 
 
81 aa  62  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1037  prevent-host-death family protein  43.42 
 
 
77 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  43.42 
 
 
76 aa  57.4  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1573  prevent-host-death family protein  38.67 
 
 
82 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2910  prevent-host-death family protein  40 
 
 
77 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.293709  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5349  prevent-host-death family protein  41.03 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  34.15 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0206  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581637  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0577  prevent-host-death family protein  36.25 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0414  prevent host death protein  36.25 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3631  prevent-host-death family protein  39.06 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6300  hypothetical protein  36.71 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2599  prevent-host-death family protein  39.06 
 
 
84 aa  48.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143583  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1572  prevent host death protein  38.27 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677398  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  41.77 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1433  prevent-host-death protein  31.58 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.205341  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1996  prevent-host-death family protein  37.68 
 
 
75 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.374935  normal  0.0428431 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  40 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3716  prevent-host-death family protein  45 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0326037 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3738  prevent-host-death family protein  38.96 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5378  prevent-host-death family protein  36.92 
 
 
64 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963401 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2443  prevent-host-death family protein  37.1 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0810105  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  38.46 
 
 
93 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0766  prevent-host-death protein  32.39 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27663  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3329  prevent-host-death family protein  36.36 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  34.43 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3368  prevent-host-death family protein  33.82 
 
 
79 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  40 
 
 
79 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4124  prevent-host-death family protein  36.71 
 
 
82 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167501  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2954  hypothetical protein  27.5 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1948  prevent-host-death family protein  38.67 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.861466  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2334  prevent-host-death protein  29.87 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2948  prevent-host-death family protein  29.87 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183383  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2969  prevent-host-death family protein  29.87 
 
 
75 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.686519 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4651  hypothetical protein  38.46 
 
 
66 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0090  prevent-host-death protein  40.48 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2647  prevent-host-death family protein  35 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4033  hypothetical protein  36.92 
 
 
76 aa  40  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.69102 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4551  prevent-host-death family protein  27.5 
 
 
80 aa  40  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0735  prevent-host-death family protein  30.19 
 
 
85 aa  40  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.836687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>