45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4124 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4124  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 82 aa  166  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167501  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  42.42 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2599  prevent-host-death family protein  46.03 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143583  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  42.31 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3368  prevent-host-death family protein  45 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5349  prevent-host-death family protein  41.03 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0206  prevent-host-death family protein  46.15 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581637  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  46.38 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  41.89 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  57.63 
 
 		 73 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  38.67 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  41.77 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  40.51 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  39.73 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3716  prevent-host-death family protein  43.64 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326037 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6300  hypothetical protein  42.31 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2443  prevent-host-death family protein  41.27 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0810105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1429  prevent-host-death family protein  39.24 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1037  prevent-host-death family protein  39.19 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0766  prevent-host-death protein  39.39 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27663  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2910  prevent-host-death family protein  45.16 
 
 		 77 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.293709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0024  prevent-host-death protein  41.43 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0065  prevent-host-death family protein  41.43 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0046  prevent-host-death family protein  41.43 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.41963  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5378  prevent-host-death family protein  40.91 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963401 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  54.17 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2334  prevent-host-death protein  42.86 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3329  prevent-host-death family protein  49.09 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2948  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183383  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2969  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686519 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4693  prevent-host-death family protein  40.62 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.490167 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0108  prevent-host-death family protein  36.36 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2423  prevent-host-death protein  37.14 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3631  prevent-host-death family protein  49.02 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2223  prevent-host-death family protein  43.42 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  37.97 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1782  prevent-host-death family protein  36.49 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3738  prevent-host-death family protein  37.18 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2530  prevent-host-death family protein  36.71 
 
 		 80 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4538  prevent-host-death family protein  37.14 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3677  prevent-host-death family protein  30.99 
 
 		 81 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763489  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  46 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3172  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 53 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0729417  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0414  prevent host death protein  33.33 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0577  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>