35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3738 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3738  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 77 aa  159  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1037  prevent-host-death family protein  59.74 
 
 		 77 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  45.95 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5349  prevent-host-death family protein  47.95 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3677  prevent-host-death family protein  46.67 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763489  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  43.75 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0206  prevent-host-death family protein  52.38 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581637  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4693  prevent-host-death family protein  54.55 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.490167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0994  prevent-host-death protein  42.11 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3716  prevent-host-death family protein  40.98 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326037 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2423  prevent-host-death protein  43.28 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  49.06 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  36.11 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 79 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0024  prevent-host-death protein  41.33 
 
 		 82 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0065  prevent-host-death family protein  41.33 
 
 		 82 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0046  prevent-host-death family protein  41.33 
 
 		 82 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.41963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  39.19 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  48.94 
 
 		 73 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2910  prevent-host-death family protein  51.22 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.293709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0775  prevent-host-death protein  40 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99719  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3631  prevent-host-death family protein  41.54 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2599  prevent-host-death family protein  44.19 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143583  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2530  prevent-host-death family protein  38.96 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0108  prevent-host-death family protein  44.74 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  35.62 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  52.94 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2443  prevent-host-death family protein  41.86 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0810105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  54.05 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4124  prevent-host-death family protein  37.18 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167501  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3686  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 		 74 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 		 76 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3368  prevent-host-death family protein  47.5 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1093  prevent-host-death family protein  42.22 
 
 		 74 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245434  unclonable  0.0000000090615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>