57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5349 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5349  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 75 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  53.95 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  43.59 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3677  prevent-host-death family protein  46.25 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763489  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3738  prevent-host-death family protein  47.95 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1037  prevent-host-death family protein  47.22 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0065  prevent-host-death family protein  45 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0046  prevent-host-death family protein  45 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.41963  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0024  prevent-host-death protein  45 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2423  prevent-host-death protein  45.12 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  64.1 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0994  prevent-host-death protein  43.21 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  53.49 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4124  prevent-host-death family protein  41.03 
 
 		 82 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167501  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  48.21 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  39.51 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3329  prevent-host-death family protein  48.84 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4693  prevent-host-death family protein  52.27 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.490167 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3631  prevent-host-death family protein  48.94 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2530  prevent-host-death family protein  41.03 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1429  prevent-host-death family protein  47.17 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0206  prevent-host-death family protein  54.35 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581637  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  46.67 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  37.66 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  36.49 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3716  prevent-host-death family protein  55.26 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2443  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0810105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2647  prevent-host-death family protein  44.64 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  41.18 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2599  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143583  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2910  prevent-host-death family protein  56.76 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.293709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0707  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0775  prevent-host-death protein  38.46 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99719  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2929  prevent-host-death family protein  44.68 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.106644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  46.94 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  42.86 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4538  prevent-host-death family protein  35 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0629  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.285054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3825  prevent-host-death protein  42.86 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0655  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  46.81 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1777  prevent-host-death family protein  42.55 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1406  prevent-host-death family protein  47.83 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5378  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963401 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0414  prevent host death protein  40.74 
 
 		 81 aa  42.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0577  prevent-host-death family protein  40.74 
 
 		 81 aa  42.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0205  prevent-host-death family protein  51.28 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171334  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0199  prevent-host-death family protein  40.24 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2223  prevent-host-death family protein  38.16 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  37.5 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  40.32 
 
 		 90 aa  41.2  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4551  prevent-host-death family protein  39.13 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2901  prevent-host-death family protein  41.86 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1566  prevent-host-death family protein  40.48 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.814372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6300  hypothetical protein  36 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0108  prevent-host-death family protein  39.02 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3886  prevent-host-death family protein  42.5 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>