44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1566 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1566  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 75 aa  151  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.814372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1996  prevent-host-death family protein  40.54 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.374935  normal  0.0428431 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  42.65 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0766  prevent-host-death protein  37.84 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27663  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  44.12 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  45.31 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4033  hypothetical protein  41.89 
 
 		 76 aa  52  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.69102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3686  prevent-host-death family protein  40.54 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  43.66 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  40.85 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1093  prevent-host-death family protein  40.54 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245434  unclonable  0.0000000090615 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  45.71 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  48.44 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3716  prevent-host-death family protein  36.62 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326037 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0206  prevent-host-death family protein  40.28 
 
 		 76 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581637  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4651  hypothetical protein  39.39 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  38.16 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5378  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 64 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963401 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1777  prevent-host-death family protein  42.31 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2423  prevent-host-death protein  37.68 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3368  prevent-host-death family protein  42.67 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3329  prevent-host-death family protein  40.85 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0735  prevent-host-death family protein  46.51 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  42.31 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3172  prevent-host-death family protein  38.3 
 
 		 53 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0729417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2910  prevent-host-death family protein  34.67 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.293709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1429  prevent-host-death family protein  33.82 
 
 		 81 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2599  prevent-host-death family protein  32.31 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143583  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0108  prevent-host-death family protein  45.24 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4551  prevent-host-death family protein  41.94 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1318  prevent-host-death family protein  42.55 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.404403  normal  0.571647 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3631  prevent-host-death family protein  48.72 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1433  prevent-host-death protein  34.94 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.205341  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5801  prevent-host-death family protein  35 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.866899  normal  0.0690534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2443  prevent-host-death family protein  31.51 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0810105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0707  prevent-host-death family protein  35.63 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2929  prevent-host-death family protein  45.83 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.106644 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1037  prevent-host-death family protein  38.46 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5349  prevent-host-death family protein  40.48 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6159  prevent-host-death family protein  46.34 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0629  prevent-host-death family protein  35.63 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.285054  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0182  hypothetical protein  43.75 
 
 		 58 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.443099  normal  0.495764 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6300  hypothetical protein  38.16 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>