23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3686 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3686  prevent-host-death family protein  100 
 
 
74 aa  148  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1093  prevent-host-death family protein  95.95 
 
 
74 aa  142  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245434  unclonable  0.0000000090615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1996  prevent-host-death family protein  60.81 
 
 
75 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.374935  normal  0.0428431 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0766  prevent-host-death protein  44 
 
 
75 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27663  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  45.59 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4033  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.69102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1566  prevent-host-death family protein  40.54 
 
 
75 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.814372 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  42.65 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  36.51 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  40.3 
 
 
78 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  41.43 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1037  prevent-host-death family protein  38.71 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  35.82 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4651  hypothetical protein  40 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4044  prevent-host-death protein  36.23 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.104043  normal  0.215101 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5378  prevent-host-death family protein  31.75 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2735  prevent-host-death family protein  30.77 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11987  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2996  prevent-host-death family protein  30.77 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206214  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  38.24 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3631  prevent-host-death family protein  38.24 
 
 
75 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3738  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 
77 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6300  hypothetical protein  44.07 
 
 
102 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4005  prevent-host-death protein  34.78 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000530556  hitchhiker  0.00000000252011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>