86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4380 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  100 
 
 
76 aa  150  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  61.54 
 
 
78 aa  99.4  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  61.84 
 
 
79 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  58.44 
 
 
81 aa  92  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3677  prevent-host-death family protein  50 
 
 
81 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763489  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  56 
 
 
78 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  51.95 
 
 
85 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6300  hypothetical protein  50 
 
 
102 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3329  prevent-host-death family protein  52.05 
 
 
79 aa  72.8  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1429  prevent-host-death family protein  47.44 
 
 
81 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2530  prevent-host-death family protein  43.59 
 
 
80 aa  72  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  44.87 
 
 
95 aa  71.2  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0206  prevent-host-death family protein  51.35 
 
 
76 aa  70.1  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581637  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2334  prevent-host-death protein  48.68 
 
 
79 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2969  prevent-host-death family protein  48.68 
 
 
75 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.686519 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2948  prevent-host-death family protein  48.68 
 
 
79 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183383  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0994  prevent-host-death protein  45.57 
 
 
82 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5349  prevent-host-death family protein  53.95 
 
 
75 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0775  prevent-host-death protein  41.77 
 
 
79 aa  66.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99719  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4693  prevent-host-death family protein  44 
 
 
80 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.490167 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  45.07 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1037  prevent-host-death family protein  46.15 
 
 
77 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1573  prevent-host-death family protein  45.33 
 
 
82 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3716  prevent-host-death family protein  45.33 
 
 
81 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0326037 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2910  prevent-host-death family protein  44 
 
 
77 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.293709  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1948  prevent-host-death family protein  52.05 
 
 
78 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.861466  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  45.33 
 
 
73 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3368  prevent-host-death family protein  47.44 
 
 
79 aa  62.8  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2423  prevent-host-death protein  48.48 
 
 
82 aa  62.8  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0065  prevent-host-death family protein  46.34 
 
 
82 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0046  prevent-host-death family protein  46.34 
 
 
82 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.41963  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  41.1 
 
 
76 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0024  prevent-host-death protein  46.34 
 
 
82 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4538  prevent-host-death family protein  42.31 
 
 
82 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4044  prevent-host-death protein  41.56 
 
 
78 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.104043  normal  0.215101 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3631  prevent-host-death family protein  40.54 
 
 
75 aa  58.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3686  prevent-host-death family protein  45.59 
 
 
74 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1093  prevent-host-death family protein  45.59 
 
 
74 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245434  unclonable  0.0000000090615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2443  prevent-host-death family protein  37.68 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0810105  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1996  prevent-host-death family protein  44.93 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.374935  normal  0.0428431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2599  prevent-host-death family protein  37.68 
 
 
84 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143583  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5378  prevent-host-death family protein  40.32 
 
 
64 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963401 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0182  hypothetical protein  53.7 
 
 
58 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.443099  normal  0.495764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0766  prevent-host-death protein  37.68 
 
 
75 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27663  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4124  prevent-host-death family protein  42.31 
 
 
82 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167501  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  39.19 
 
 
79 aa  53.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4005  prevent-host-death protein  33.77 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000530556  hitchhiker  0.00000000252011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  43.59 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  46.15 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2184  prevent-host-death family protein  31.65 
 
 
85 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.415142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1572  prevent host death protein  43.66 
 
 
80 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677398  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0414  prevent host death protein  45.45 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0577  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1566  prevent-host-death family protein  45.71 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.814372 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3738  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2939  prevent-host-death family protein  36.49 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100426  normal  0.275009 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0199  prevent-host-death family protein  37.35 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172056  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2929  prevent-host-death family protein  47.92 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.106644 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2223  prevent-host-death family protein  41.79 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3232  prevent-host-death protein  36.92 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.527202  normal  0.0182559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  56.1 
 
 
90 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1315  prevent-host-death family protein  43.1 
 
 
78 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147155  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1433  prevent-host-death protein  37.5 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.205341  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4033  hypothetical protein  35.21 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.69102 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3527  prevent-host-death family protein  53.66 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378115  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4651  hypothetical protein  40.62 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2647  prevent-host-death family protein  46.3 
 
 
89 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1777  prevent-host-death family protein  42.55 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2038  prevent-host-death family protein  35.44 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2996  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206214  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0119  prevent-host-death protein  31.34 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2735  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
86 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11987  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0707  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 
89 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00390  hypothetical protein  44.9 
 
 
49 aa  43.5  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.059073 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3369  prevent-host-death family protein  46.81 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0934085  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0108  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0655  prevent-host-death family protein  37.8 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0629  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.285054  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  47.73 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3825  prevent-host-death protein  37.8 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2386  prevent-host-death family protein  29.49 
 
 
97 aa  41.2  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3050  prevent-host-death family protein  44.68 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4369  prevent-host-death protein  32 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.862707 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4551  prevent-host-death family protein  40.91 
 
 
80 aa  40.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1066  prevent-host-death family protein  41.43 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3011  prevent-host-death family protein  39.53 
 
 
92 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>