28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3011 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3011  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 92 aa  182  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3369  prevent-host-death family protein  75 
 
 		 86 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0934085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2762  prevent-host-death family protein  74.32 
 
 		 82 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.954217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1066  prevent-host-death family protein  61.36 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3784  hypothetical protein  64.1 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640007  decreased coverage  0.000191951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2038  prevent-host-death family protein  44.78 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  52.5 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3077  prevent-host-death protein  52 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.128472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  57.5 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1948  prevent-host-death family protein  56.82 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.861466  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3054  prevent-host-death family protein  56.1 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.326995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2901  prevent-host-death family protein  52.27 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0061  prevent-host-death family protein  48.78 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933415  normal  0.536193 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4551  prevent-host-death family protein  32.97 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  51.22 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2596  prevent-host-death family protein  46.81 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2983  prevent-host-death family protein  46.81 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.413921  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1782  prevent-host-death family protein  45 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1545  prevent-host-death family protein  49.06 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0610956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3329  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3886  prevent-host-death family protein  35.94 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1406  prevent-host-death family protein  45 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  52.63 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2469  prevent-host-death family protein  54.29 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117875  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2929  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.106644 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  42.22 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3716  prevent-host-death family protein  37.25 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0212  prevent-host-death family protein  44.68 
 
 		 89 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.655671  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>