39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3369 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3369  prevent-host-death family protein  100 
 
 
86 aa  170  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0934085  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3011  prevent-host-death family protein  75 
 
 
92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2762  prevent-host-death family protein  79.71 
 
 
82 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.954217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1066  prevent-host-death family protein  65.91 
 
 
78 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  55 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3784  hypothetical protein  61.54 
 
 
79 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640007  decreased coverage  0.000191951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2038  prevent-host-death family protein  38.55 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  46.75 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3054  prevent-host-death family protein  58.54 
 
 
91 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.326995  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3077  prevent-host-death protein  52 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.128472  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0061  prevent-host-death family protein  50 
 
 
93 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933415  normal  0.536193 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  44.07 
 
 
73 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2901  prevent-host-death family protein  39.06 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1948  prevent-host-death family protein  54.55 
 
 
78 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.861466  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4667  prevent-host-death family protein  39.74 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.511085 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1782  prevent-host-death family protein  34.85 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  46.81 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2983  prevent-host-death family protein  39.06 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.413921  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  38.33 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2596  prevent-host-death family protein  39.06 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0707  prevent-host-death family protein  47.62 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2647  prevent-host-death family protein  45.24 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1406  prevent-host-death family protein  47.5 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.190407  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  44.19 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0629  prevent-host-death family protein  47.62 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.285054  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3886  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 
83 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3716  prevent-host-death family protein  37.25 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0326037 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0655  prevent-host-death family protein  47.62 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3825  prevent-host-death protein  47.62 
 
 
89 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0575  prevent-host-death protein  44.23 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103149  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1545  prevent-host-death family protein  49.06 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0610956  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2929  prevent-host-death family protein  44.19 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.106644 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3050  prevent-host-death family protein  34.21 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2469  prevent-host-death family protein  54.29 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117875  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1315  prevent-host-death family protein  41.3 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  42.55 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0212  prevent-host-death family protein  44.68 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.655671  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  52.63 
 
 
78 aa  40  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2423  prevent-host-death protein  43.9 
 
 
82 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>