35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1066 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1066  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 78 aa  154  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3369  prevent-host-death family protein  65.91 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0934085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3011  prevent-host-death family protein  61.36 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2762  prevent-host-death family protein  57.14 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.954217  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2038  prevent-host-death family protein  52.08 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3886  prevent-host-death family protein  54.55 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  57.5 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3784  hypothetical protein  63.16 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640007  decreased coverage  0.000191951 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3054  prevent-host-death family protein  60.98 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.326995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1315  prevent-host-death family protein  51.16 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147155  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2596  prevent-host-death family protein  57.5 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2983  prevent-host-death family protein  57.5 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.413921  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0061  prevent-host-death family protein  47.27 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933415  normal  0.536193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2929  prevent-host-death family protein  53.33 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.106644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  55 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2939  prevent-host-death family protein  54.76 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100426  normal  0.275009 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2469  prevent-host-death family protein  56.6 
 
 		 96 aa  42.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117875  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3329  prevent-host-death family protein  52.38 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0575  prevent-host-death protein  57.58 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103149  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1782  prevent-host-death family protein  52.5 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2996  prevent-host-death family protein  44.9 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206214  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0108  prevent-host-death family protein  37.93 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4667  prevent-host-death family protein  45 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.511085 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2735  prevent-host-death family protein  44.9 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1318  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.404403  normal  0.571647 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  47.73 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1429  prevent-host-death family protein  36.99 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1470  prevent-host-death family protein  41.54 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.672618 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5801  prevent-host-death family protein  57.14 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.866899  normal  0.0690534 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0199  prevent-host-death family protein  51.22 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172056  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  41.43 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1948  prevent-host-death family protein  59.46 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.861466  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4551  prevent-host-death family protein  51.11 
 
 		 80 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  52.5 
 
 		 78 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>