62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2929 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2929  prevent-host-death family protein  100 
 
 
80 aa  158  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.106644 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4551  prevent-host-death family protein  75.95 
 
 
80 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1318  prevent-host-death family protein  70.89 
 
 
80 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.404403  normal  0.571647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3050  prevent-host-death family protein  74.68 
 
 
80 aa  110  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1704  prevent-host-death family protein  49.35 
 
 
80 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1698  prevent-host-death family protein  49.35 
 
 
80 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.032948 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5801  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 
82 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.866899  normal  0.0690534 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2596  prevent-host-death family protein  44.59 
 
 
80 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2983  prevent-host-death family protein  44.59 
 
 
80 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.413921  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1315  prevent-host-death family protein  42.5 
 
 
78 aa  57.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147155  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3886  prevent-host-death family protein  43.9 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  58.7 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0775  prevent-host-death protein  52.27 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99719  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  51.92 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3527  prevent-host-death family protein  63.41 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378115  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  47.73 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4705  prevent-host-death family protein  56.41 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.087164  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  50.91 
 
 
81 aa  48.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  47.92 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0199  prevent-host-death family protein  55.1 
 
 
85 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172056  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1433  prevent-host-death protein  63.89 
 
 
84 aa  47.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.205341  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  60.98 
 
 
90 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3172  prevent-host-death family protein  56.41 
 
 
53 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0729417  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5349  prevent-host-death family protein  44.68 
 
 
75 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1777  prevent-host-death family protein  43.1 
 
 
83 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0735  prevent-host-death family protein  52.63 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3368  prevent-host-death family protein  53.66 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0108  prevent-host-death family protein  38.46 
 
 
71 aa  44.3  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2647  prevent-host-death family protein  47.92 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6159  prevent-host-death family protein  51.22 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598446  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1066  prevent-host-death family protein  53.33 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  40 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3329  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  48.94 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0575  prevent-host-death protein  61.76 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103149  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2762  prevent-host-death family protein  38.24 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.954217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  43.18 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1429  prevent-host-death family protein  51.28 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  40 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0707  prevent-host-death family protein  46.81 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1782  prevent-host-death family protein  43.75 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5378  prevent-host-death family protein  44.68 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963401 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  40.24 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3775  prevent-host-death family protein  32.47 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2038  prevent-host-death family protein  42.11 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0061  prevent-host-death family protein  43.9 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933415  normal  0.536193 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3825  prevent-host-death protein  46.81 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0655  prevent-host-death family protein  45.83 
 
 
89 aa  42  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0629  prevent-host-death family protein  45.83 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.285054  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2735  prevent-host-death family protein  40 
 
 
86 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11987  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3631  prevent-host-death family protein  44.68 
 
 
75 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2996  prevent-host-death family protein  44.68 
 
 
96 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206214  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  45.65 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  62.16 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2602  prevent-host-death family protein  38.6 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406254  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1566  prevent-host-death family protein  45.83 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.814372 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3369  prevent-host-death family protein  44.19 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0934085  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3011  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1621  prevent-host-death family protein  34.78 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3455  prevent-host-death family protein  50 
 
 
85 aa  40  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.825044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4667  prevent-host-death family protein  40.35 
 
 
97 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.511085 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1816  prevent-host-death family protein  39.24 
 
 
83 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00000021208  hitchhiker  0.0000000000223341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>