28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2762 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2762  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 82 aa  165  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.954217  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3011  prevent-host-death family protein  74.32 
 
 		 92 aa  116  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3369  prevent-host-death family protein  79.71 
 
 		 86 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0934085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2038  prevent-host-death family protein  37.93 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1066  prevent-host-death family protein  57.14 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3784  hypothetical protein  56.41 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640007  decreased coverage  0.000191951 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1782  prevent-host-death family protein  35.44 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2983  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.413921  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2596  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0061  prevent-host-death family protein  47.62 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933415  normal  0.536193 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  47.5 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3054  prevent-host-death family protein  39.74 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.326995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3886  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4551  prevent-host-death family protein  38.57 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1318  prevent-host-death family protein  43.33 
 
 		 80 aa  44.3  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.404403  normal  0.571647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2929  prevent-host-death family protein  38.24 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.106644 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2901  prevent-host-death family protein  39.02 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2469  prevent-host-death family protein  52.78 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1777  prevent-host-death family protein  48.78 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0212  prevent-host-death family protein  45.83 
 
 		 89 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.655671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  41.3 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2619  prevent-host-death family protein  40.91 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1948  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.861466  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5378  prevent-host-death family protein  44.19 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963401 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  51.22 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  40.68 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3527  prevent-host-death family protein  39.13 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378115  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  50 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>