74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3784 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3784  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  154  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640007  decreased coverage  0.000191951 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  61.4 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2038  prevent-host-death family protein  54.55 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2901  prevent-host-death family protein  49.21 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1670  prevent-host-death family protein  46.88 
 
 		 80 aa  57  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3011  prevent-host-death family protein  63.41 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2599  prevent-host-death family protein  41.18 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143583  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1406  prevent-host-death family protein  65.79 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3369  prevent-host-death family protein  60.98 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0934085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2762  prevent-host-death family protein  48.15 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.954217  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  54.76 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2596  prevent-host-death family protein  61.54 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2983  prevent-host-death family protein  61.54 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.413921  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3054  prevent-host-death family protein  68.75 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.326995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0206  prevent-host-death family protein  58.54 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581637  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6159  prevent-host-death family protein  62.79 
 
 		 79 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  34.94 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1948  prevent-host-death family protein  57.45 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.861466  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2443  prevent-host-death family protein  58.33 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0810105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  56.82 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3368  prevent-host-death family protein  38.57 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3716  prevent-host-death family protein  45.65 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326037 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4551  prevent-host-death family protein  52.38 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2939  prevent-host-death family protein  56.1 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100426  normal  0.275009 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3886  prevent-host-death family protein  54.76 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1318  prevent-host-death family protein  62.16 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.404403  normal  0.571647 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1782  prevent-host-death family protein  54.35 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2469  prevent-host-death family protein  54.72 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117875  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  38.46 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1429  prevent-host-death family protein  41.18 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1066  prevent-host-death family protein  63.16 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  55.88 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  51.22 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0108  prevent-host-death family protein  40.32 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  53.85 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  51.28 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2423  prevent-host-death protein  31.51 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0061  prevent-host-death family protein  41.07 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933415  normal  0.536193 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3329  prevent-host-death family protein  51.16 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3077  prevent-host-death protein  52.5 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.128472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4434  prevent-host-death protein  39.62 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0804206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  48.89 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1816  prevent-host-death family protein  51.28 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00000021208  hitchhiker  0.0000000000223341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0212  prevent-host-death family protein  47.83 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.655671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3631  prevent-host-death family protein  67.65 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  53.85 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4124  prevent-host-death family protein  57.5 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167501  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2637  prevent-host-death protein  33.33 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1545  prevent-host-death family protein  58.33 
 
 		 83 aa  42.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0610956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0577  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2929  prevent-host-death family protein  51.22 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.106644 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1572  prevent host death protein  53.66 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677398  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0414  prevent host death protein  45.45 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5378  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963401 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4693  prevent-host-death family protein  27.27 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.490167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2223  prevent-host-death family protein  61.11 
 
 		 81 aa  41.2  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3752  prevent-host-death family protein  41.82 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2206  prevent-host-death protein  47.37 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.429062  normal  0.232261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1539  prevent-host-death family protein  45.24 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3866  prevent-host-death family protein  44 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.972321  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3775  prevent-host-death family protein  55.26 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0062  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  34.25 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2966  prevent-host-death family protein  44.62 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00596285  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3172  prevent-host-death family protein  48.72 
 
 		 53 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0729417  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2647  prevent-host-death family protein  48.84 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5801  prevent-host-death family protein  55.26 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.866899  normal  0.0690534 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0735  prevent-host-death family protein  48.57 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0994  prevent-host-death protein  28.77 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0629  prevent-host-death family protein  47.62 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.285054  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5571  prevent-host-death family protein  55.26 
 
 		 82 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00661607  normal  0.119215 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1433  prevent-host-death protein  50 
 
 		 84 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.205341  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3677  prevent-host-death family protein  31.51 
 
 		 81 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763489  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0205  prevent-host-death family protein  35.71 
 
 		 88 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>