49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1318 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1318  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 80 aa  157  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.404403  normal  0.571647 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4551  prevent-host-death family protein  82.5 
 
 		 80 aa  134  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2929  prevent-host-death family protein  70.89 
 
 		 80 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.106644 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3050  prevent-host-death family protein  71.25 
 
 		 80 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5801  prevent-host-death family protein  51.22 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.866899  normal  0.0690534 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1698  prevent-host-death family protein  53.85 
 
 		 80 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.032948 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1704  prevent-host-death family protein  53.85 
 
 		 80 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2983  prevent-host-death family protein  47.95 
 
 		 80 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.413921  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2596  prevent-host-death family protein  47.95 
 
 		 80 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3886  prevent-host-death family protein  45.78 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1315  prevent-host-death family protein  42.5 
 
 		 78 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147155  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3172  prevent-host-death family protein  55.56 
 
 		 53 aa  50.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0729417  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2038  prevent-host-death family protein  41.56 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4705  prevent-host-death family protein  51.11 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.087164  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1433  prevent-host-death protein  62.86 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.205341  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  42.55 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  51.22 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1948  prevent-host-death family protein  57.14 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.861466  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6159  prevent-host-death family protein  53.85 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0061  prevent-host-death family protein  34.88 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933415  normal  0.536193 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3784  hypothetical protein  61.76 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640007  decreased coverage  0.000191951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2762  prevent-host-death family protein  43.33 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.954217  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  52.63 
 
 		 104 aa  42.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0199  prevent-host-death family protein  53.85 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3368  prevent-host-death family protein  48.78 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1566  prevent-host-death family protein  42.55 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.814372 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  43.18 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2223  prevent-host-death family protein  54.05 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2469  prevent-host-death family protein  53.85 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117875  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3455  prevent-host-death family protein  51.28 
 
 		 85 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.825044 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0735  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4667  prevent-host-death family protein  51.28 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.511085 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  39.53 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1545  prevent-host-death family protein  47.92 
 
 		 83 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0610956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2206  prevent-host-death protein  36.84 
 
 		 89 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.429062  normal  0.232261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  41.67 
 
 		 90 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0108  prevent-host-death family protein  41.03 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  33.78 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2901  prevent-host-death family protein  47.83 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1716  prevent-host-death family protein  47.62 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1066  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3527  prevent-host-death family protein  46.15 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378115  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 		 82 aa  40.8  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1621  prevent-host-death family protein  32.97 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3775  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13203  hypothetical protein  51.43 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000210016  normal  0.314571 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1406  prevent-host-death family protein  34.18 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3019  prevent-host-death family protein  54.29 
 
 		 151 aa  40.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0212  prevent-host-death family protein  40.91 
 
 		 89 aa  40  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.655671  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>