32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1406 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1406  prevent-host-death family protein  100 
 
 
79 aa  160  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.190407  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1670  prevent-host-death family protein  54.43 
 
 
80 aa  84.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2901  prevent-host-death family protein  48.72 
 
 
79 aa  84  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  44.3 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4443  prevent-host-death family protein  47.62 
 
 
72 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.122242 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0479  prevent-host-death family protein  39.47 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3784  hypothetical protein  65.79 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640007  decreased coverage  0.000191951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2038  prevent-host-death family protein  40 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1816  prevent-host-death family protein  37.97 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00000021208  hitchhiker  0.0000000000223341 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1429  prevent-host-death family protein  51.11 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2929  prevent-host-death family protein  48.78 
 
 
83 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  36.25 
 
 
78 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3054  prevent-host-death family protein  50 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.326995  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1545  prevent-host-death family protein  32 
 
 
83 aa  45.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0610956  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  50 
 
 
95 aa  44.7  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5349  prevent-host-death family protein  47.83 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1948  prevent-host-death family protein  58.33 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.861466  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  46.81 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2206  prevent-host-death protein  32.58 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.429062  normal  0.232261 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0206  prevent-host-death family protein  50 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581637  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0261  prevent-host-death family protein  30.59 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.879783  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3677  prevent-host-death family protein  40.38 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763489  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4693  prevent-host-death family protein  34.67 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.490167 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3369  prevent-host-death family protein  47.5 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0934085  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2469  prevent-host-death family protein  52.63 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117875  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5571  prevent-host-death family protein  51.22 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00661607  normal  0.119215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3011  prevent-host-death family protein  45 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1318  prevent-host-death family protein  34.18 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.404403  normal  0.571647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0199  prevent-host-death family protein  41.27 
 
 
85 aa  40  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172056  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1782  prevent-host-death family protein  35.44 
 
 
78 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3752  prevent-host-death family protein  38.3 
 
 
85 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>