77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1204 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  100 
 
 
104 aa  212  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1406  prevent-host-death family protein  44.3 
 
 
79 aa  81.3  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.190407  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1670  prevent-host-death family protein  37.97 
 
 
80 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2901  prevent-host-death family protein  39.74 
 
 
79 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2038  prevent-host-death family protein  62.07 
 
 
85 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3784  hypothetical protein  73.68 
 
 
79 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640007  decreased coverage  0.000191951 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3054  prevent-host-death family protein  39.56 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.326995  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3369  prevent-host-death family protein  55 
 
 
86 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0934085  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0479  prevent-host-death family protein  40.79 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3886  prevent-host-death family protein  40.24 
 
 
83 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3011  prevent-host-death family protein  52.5 
 
 
92 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1777  prevent-host-death family protein  36 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  55 
 
 
78 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  52.27 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1545  prevent-host-death family protein  38.75 
 
 
83 aa  50.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0610956  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  52.27 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1315  prevent-host-death family protein  38.55 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147155  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2596  prevent-host-death family protein  52.38 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5349  prevent-host-death family protein  36.49 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2983  prevent-host-death family protein  52.38 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.413921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  55 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12845  hypothetical protein  58.97 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000444858  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  48.89 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4443  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 
72 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.122242 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2929  prevent-host-death family protein  42.62 
 
 
83 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  45.45 
 
 
81 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1816  prevent-host-death family protein  38.46 
 
 
83 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00000021208  hitchhiker  0.0000000000223341 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1066  prevent-host-death family protein  57.5 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2762  prevent-host-death family protein  47.5 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.954217  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2996  prevent-host-death family protein  38.36 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206214  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  52.38 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0206  prevent-host-death family protein  55 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581637  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1429  prevent-host-death family protein  57.5 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  42.11 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  50 
 
 
90 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3050  prevent-host-death family protein  40.96 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3329  prevent-host-death family protein  47.83 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0108  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3527  prevent-host-death family protein  36.23 
 
 
82 aa  43.5  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378115  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0655  prevent-host-death family protein  37.97 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4693  prevent-host-death family protein  34 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.490167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0061  prevent-host-death family protein  47.62 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933415  normal  0.536193 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1782  prevent-host-death family protein  39.66 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4551  prevent-host-death family protein  43.4 
 
 
80 aa  42.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1948  prevent-host-death family protein  54.76 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.861466  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  44.9 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2599  prevent-host-death family protein  47.06 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143583  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0629  prevent-host-death family protein  37.97 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.285054  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2469  prevent-host-death family protein  53.85 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117875  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2647  prevent-host-death family protein  40.62 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6159  prevent-host-death family protein  63.89 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598446  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1318  prevent-host-death family protein  52.63 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.404403  normal  0.571647 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0707  prevent-host-death family protein  39.06 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5378  prevent-host-death family protein  48.65 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963401 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3077  prevent-host-death protein  46 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.128472  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  47.73 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3775  prevent-host-death family protein  41.25 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0414  prevent host death protein  45.45 
 
 
81 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0046  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 
82 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.41963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3368  prevent-host-death family protein  46.15 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0024  prevent-host-death protein  41.67 
 
 
82 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3825  prevent-host-death protein  37.97 
 
 
89 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1901  prevent-host-death family protein  42.22 
 
 
78 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00389172  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0577  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 
81 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4538  prevent-host-death family protein  45.24 
 
 
82 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0065  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 
82 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3631  prevent-host-death family protein  56.76 
 
 
75 aa  41.2  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1572  prevent host death protein  47.73 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677398  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2735  prevent-host-death family protein  40.62 
 
 
86 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11987  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2443  prevent-host-death family protein  48.48 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0810105  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2929  prevent-host-death family protein  45.65 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.106644 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3716  prevent-host-death family protein  45.95 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0326037 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4256  prevent-host-death family protein  50 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143175 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3866  prevent-host-death family protein  43.59 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.972321  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3677  prevent-host-death family protein  43.59 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763489  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0062  prevent-host-death family protein  47.5 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5571  prevent-host-death family protein  51.22 
 
 
82 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00661607  normal  0.119215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>