56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2443 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2443  prevent-host-death family protein  100 
 
 
83 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0810105  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2599  prevent-host-death family protein  90.24 
 
 
84 aa  153  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143583  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  45.95 
 
 
76 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  43.48 
 
 
78 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  39.47 
 
 
79 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  37.68 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  32.89 
 
 
78 aa  57.8  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  48.39 
 
 
95 aa  57  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4693  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.490167 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0065  prevent-host-death family protein  47.69 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0024  prevent-host-death protein  47.69 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0046  prevent-host-death family protein  47.69 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.41963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3368  prevent-host-death family protein  40.26 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0206  prevent-host-death family protein  37.68 
 
 
76 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581637  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3716  prevent-host-death family protein  31.88 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0326037 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2423  prevent-host-death protein  37.84 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1429  prevent-host-death family protein  37.31 
 
 
81 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4124  prevent-host-death family protein  41.27 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167501  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5349  prevent-host-death family protein  50 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3677  prevent-host-death family protein  37.1 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763489  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  34.29 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2596  prevent-host-death family protein  58.82 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2983  prevent-host-death family protein  58.82 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.413921  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3784  hypothetical protein  58.82 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640007  decreased coverage  0.000191951 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  51.28 
 
 
82 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  36.62 
 
 
73 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0108  prevent-host-death family protein  51.35 
 
 
71 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1572  prevent host death protein  35.06 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677398  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  34.62 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3738  prevent-host-death family protein  41.86 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2530  prevent-host-death family protein  37.1 
 
 
80 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2647  prevent-host-death family protein  55.26 
 
 
89 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2910  prevent-host-death family protein  39.29 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.293709  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0199  prevent-host-death family protein  57.14 
 
 
85 aa  42.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172056  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1948  prevent-host-death family protein  53.19 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.861466  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  61.11 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3631  prevent-host-death family protein  37.14 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0577  prevent-host-death family protein  35.14 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0707  prevent-host-death family protein  55.26 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0994  prevent-host-death protein  32.31 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4551  prevent-host-death family protein  46.15 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0414  prevent host death protein  35.14 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0775  prevent-host-death protein  35.14 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99719  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0655  prevent-host-death family protein  55.26 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3329  prevent-host-death family protein  48.65 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0766  prevent-host-death protein  35.48 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27663  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3825  prevent-host-death protein  55.26 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0629  prevent-host-death family protein  55.26 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.285054  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1777  prevent-host-death family protein  43.14 
 
 
83 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  47.5 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  30.26 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1566  prevent-host-death family protein  31.51 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.814372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2223  prevent-host-death family protein  41.94 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  48.48 
 
 
104 aa  41.2  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3050  prevent-host-death family protein  32.88 
 
 
80 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3886  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 
83 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>