51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3716 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3716  prevent-host-death family protein  100 
 
 
81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0326037 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0206  prevent-host-death family protein  66.22 
 
 
76 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581637  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  58.11 
 
 
76 aa  86.3  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3329  prevent-host-death family protein  47.5 
 
 
79 aa  72.8  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  49.33 
 
 
78 aa  68.2  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  41.89 
 
 
79 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  45.33 
 
 
76 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  47.37 
 
 
78 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  39.74 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2423  prevent-host-death protein  42.67 
 
 
82 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  46.67 
 
 
73 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2910  prevent-host-death family protein  41.89 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.293709  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0108  prevent-host-death family protein  52.17 
 
 
71 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2599  prevent-host-death family protein  34.78 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143583  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1429  prevent-host-death family protein  35.14 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2443  prevent-host-death family protein  31.88 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0810105  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2939  prevent-host-death family protein  41.56 
 
 
79 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100426  normal  0.275009 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3677  prevent-host-death family protein  46.3 
 
 
81 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763489  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3738  prevent-host-death family protein  40.98 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  40.35 
 
 
95 aa  50.8  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4693  prevent-host-death family protein  55.26 
 
 
80 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.490167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  40 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3631  prevent-host-death family protein  39.13 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5349  prevent-host-death family protein  55.26 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1566  prevent-host-death family protein  36.62 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.814372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1037  prevent-host-death family protein  40.98 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4124  prevent-host-death family protein  43.64 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167501  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  36.92 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  43.14 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  50 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2223  prevent-host-death family protein  48.98 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3784  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640007  decreased coverage  0.000191951 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2530  prevent-host-death family protein  45 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0994  prevent-host-death protein  42.22 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0775  prevent-host-death protein  42.86 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99719  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0065  prevent-host-death family protein  41.18 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0046  prevent-host-death family protein  41.18 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.41963  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0024  prevent-host-death protein  41.18 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1948  prevent-host-death family protein  52.78 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.861466  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6159  prevent-host-death family protein  43.59 
 
 
79 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598446  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3369  prevent-host-death family protein  37.25 
 
 
86 aa  41.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0934085  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3368  prevent-host-death family protein  42.11 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6308  prevent-host-death family protein  34.85 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3775  prevent-host-death family protein  45.24 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4044  prevent-host-death protein  35.06 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.104043  normal  0.215101 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  45.95 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  34.85 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2647  prevent-host-death family protein  43.9 
 
 
89 aa  40.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1782  prevent-host-death family protein  44.68 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2038  prevent-host-death family protein  41.86 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3011  prevent-host-death family protein  37.25 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>