64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2423 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2423  prevent-host-death protein  100 
 
 		 82 aa  165  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4693  prevent-host-death family protein  70.67 
 
 		 80 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.490167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3677  prevent-host-death family protein  64.56 
 
 		 81 aa  103  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763489  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2184  prevent-host-death family protein  61.54 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.415142  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2530  prevent-host-death family protein  58.02 
 
 		 80 aa  94  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  60.27 
 
 		 85 aa  92  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0065  prevent-host-death family protein  55 
 
 		 82 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0024  prevent-host-death protein  55 
 
 		 82 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0046  prevent-host-death family protein  55 
 
 		 82 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.41963  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0994  prevent-host-death protein  53.16 
 
 		 82 aa  89  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  46.75 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4538  prevent-host-death family protein  50.63 
 
 		 82 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0775  prevent-host-death protein  48.05 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99719  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  43.75 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1037  prevent-host-death family protein  43.59 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  48.48 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3368  prevent-host-death family protein  42.65 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  36.36 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3716  prevent-host-death family protein  42.67 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326037 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0199  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172056  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2599  prevent-host-death family protein  41.89 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143583  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1429  prevent-host-death family protein  43.94 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  38.96 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5349  prevent-host-death family protein  45.12 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0206  prevent-host-death family protein  51.22 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581637  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  40.24 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0414  prevent host death protein  35.71 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0577  prevent-host-death family protein  35.71 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2910  prevent-host-death family protein  39.19 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.293709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2443  prevent-host-death family protein  37.84 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0810105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  44.62 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1572  prevent host death protein  36.76 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677398  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3738  prevent-host-death family protein  43.28 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  38.46 
 
 		 73 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0707  prevent-host-death family protein  38.75 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0655  prevent-host-death family protein  38.75 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3825  prevent-host-death protein  38.75 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4005  prevent-host-death protein  31.25 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000530556  hitchhiker  0.00000000252011 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3631  prevent-host-death family protein  39.34 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1573  prevent-host-death family protein  37.66 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0629  prevent-host-death family protein  38.75 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.285054  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0108  prevent-host-death family protein  46.51 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4044  prevent-host-death protein  32.5 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.104043  normal  0.215101 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2735  prevent-host-death family protein  33.78 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2996  prevent-host-death family protein  33.78 
 
 		 96 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206214  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1433  prevent-host-death protein  34.25 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.205341  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2647  prevent-host-death family protein  36 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  41.82 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  36.36 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0766  prevent-host-death protein  32.84 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27663  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1566  prevent-host-death family protein  37.68 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.814372 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4124  prevent-host-death family protein  37.14 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167501  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6300  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0119  prevent-host-death protein  33.33 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3329  prevent-host-death family protein  34.72 
 
 		 79 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4651  hypothetical protein  37.31 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4033  hypothetical protein  31.82 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.69102 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5378  prevent-host-death family protein  35 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963401 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  32.35 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0735  prevent-host-death family protein  35.19 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3527  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 82 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378115  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3369  prevent-host-death family protein  43.9 
 
 		 86 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0934085  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>