43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0414 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0414  prevent host death protein  100 
 
 		 81 aa  166  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0577  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 81 aa  166  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1572  prevent host death protein  75.32 
 
 		 80 aa  121  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677398  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  48.15 
 
 		 82 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0707  prevent-host-death family protein  46.58 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  45.95 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0655  prevent-host-death family protein  46.58 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0629  prevent-host-death family protein  46.58 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.285054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3825  prevent-host-death protein  46.58 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2647  prevent-host-death family protein  45.21 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4538  prevent-host-death family protein  38.75 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0994  prevent-host-death protein  41.46 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3677  prevent-host-death family protein  40.24 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763489  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  43.28 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1037  prevent-host-death family protein  36.84 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  42.65 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2423  prevent-host-death protein  35.71 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  38.03 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4693  prevent-host-death family protein  39.71 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.490167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  45.59 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  42.67 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1429  prevent-host-death family protein  43.28 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  35.62 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2530  prevent-host-death family protein  36.25 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0046  prevent-host-death family protein  37.35 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.41963  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0065  prevent-host-death family protein  37.35 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0024  prevent-host-death protein  37.35 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  46.3 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0206  prevent-host-death family protein  41.38 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581637  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  46.77 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2599  prevent-host-death family protein  37.84 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143583  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2184  prevent-host-death family protein  32.05 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.415142  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  38.46 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2443  prevent-host-death family protein  35.14 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0810105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0766  prevent-host-death protein  31.82 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27663  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5349  prevent-host-death family protein  40.74 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  45.45 
 
 		 104 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  35.14 
 
 		 79 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3784  hypothetical protein  46.34 
 
 		 79 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640007  decreased coverage  0.000191951 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3631  prevent-host-death family protein  35.38 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1573  prevent-host-death family protein  40.26 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4124  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>