54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4538 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4538  prevent-host-death family protein  100 
 
 
82 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0065  prevent-host-death family protein  57.5 
 
 
82 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0024  prevent-host-death protein  57.5 
 
 
82 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0046  prevent-host-death family protein  57.5 
 
 
82 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.41963  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4693  prevent-host-death family protein  51.95 
 
 
80 aa  87  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.490167 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2530  prevent-host-death family protein  51.28 
 
 
80 aa  85.5  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  50.65 
 
 
85 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3677  prevent-host-death family protein  53.09 
 
 
81 aa  83.6  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763489  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0994  prevent-host-death protein  45.12 
 
 
82 aa  83.6  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2423  prevent-host-death protein  50.63 
 
 
82 aa  82  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2184  prevent-host-death family protein  46.75 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.415142  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0775  prevent-host-death protein  43.59 
 
 
79 aa  73.9  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99719  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  45.68 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  48.72 
 
 
81 aa  68.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  46.84 
 
 
78 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  43.04 
 
 
79 aa  67  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  42.31 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1429  prevent-host-death family protein  38.27 
 
 
81 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0414  prevent host death protein  38.75 
 
 
81 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0577  prevent-host-death family protein  38.75 
 
 
81 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6300  hypothetical protein  43.59 
 
 
102 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1037  prevent-host-death family protein  38.96 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1572  prevent host death protein  41.98 
 
 
80 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677398  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  44.74 
 
 
73 aa  54.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  40.32 
 
 
76 aa  53.9  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  42.11 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1573  prevent-host-death family protein  38.16 
 
 
82 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3631  prevent-host-death family protein  45.31 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  38.46 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1996  prevent-host-death family protein  41.43 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.374935  normal  0.0428431 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2910  prevent-host-death family protein  36.71 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.293709  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0199  prevent-host-death family protein  36.05 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172056  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0206  prevent-host-death family protein  44.64 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581637  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2969  prevent-host-death family protein  38.46 
 
 
75 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.686519 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2948  prevent-host-death family protein  38.46 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183383  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2334  prevent-host-death protein  38.46 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2599  prevent-host-death family protein  39.13 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143583  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  43.75 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5349  prevent-host-death family protein  35 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3329  prevent-host-death family protein  43.59 
 
 
79 aa  45.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2735  prevent-host-death family protein  35.62 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11987  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2996  prevent-host-death family protein  35.62 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206214  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0754  prevent-host-death family protein  32.5 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.163411  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4005  prevent-host-death protein  29.49 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000530556  hitchhiker  0.00000000252011 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0575  prevent-host-death protein  55.88 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103149  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4044  prevent-host-death protein  29.49 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.104043  normal  0.215101 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  32.43 
 
 
78 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4124  prevent-host-death family protein  37.14 
 
 
82 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167501  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1433  prevent-host-death protein  35.62 
 
 
84 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.205341  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  45.24 
 
 
104 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3368  prevent-host-death family protein  33.8 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0119  prevent-host-death protein  25.76 
 
 
67 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0355  hypothetical protein  34.29 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659546  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>