32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1996 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1996  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 75 aa  152  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.374935  normal  0.0428431 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1093  prevent-host-death family protein  63.51 
 
 		 74 aa  92  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245434  unclonable  0.0000000090615 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3686  prevent-host-death family protein  60.81 
 
 		 74 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0766  prevent-host-death protein  50.68 
 
 		 75 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27663  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4033  hypothetical protein  41.89 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.69102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6300  hypothetical protein  44 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5378  prevent-host-death family protein  50.79 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963401 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1566  prevent-host-death family protein  40.54 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.814372 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  44.93 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  44.93 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2334  prevent-host-death protein  42.11 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2948  prevent-host-death family protein  42.11 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183383  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2969  prevent-host-death family protein  45.59 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686519 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  43.28 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4651  hypothetical protein  39.06 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  39.68 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4538  prevent-host-death family protein  41.43 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  40.3 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  42.19 
 
 		 93 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  40 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4044  prevent-host-death protein  34.78 
 
 		 78 aa  47.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.104043  normal  0.215101 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0279  hypothetical protein  36.49 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4005  prevent-host-death protein  44.44 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000530556  hitchhiker  0.00000000252011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2530  prevent-host-death family protein  37.68 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1429  prevent-host-death family protein  34.29 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0994  prevent-host-death protein  30.3 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1037  prevent-host-death family protein  37.1 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1409  hypothetical protein  60 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.877635  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2910  prevent-host-death family protein  36.49 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.293709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  40.58 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2737  hypothetical protein  52.94 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00868215  hitchhiker  0.00000853136 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  33.33 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>