32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2334 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2334  prevent-host-death protein  100 
 
 
79 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2948  prevent-host-death family protein  100 
 
 
79 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183383  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2969  prevent-host-death family protein  100 
 
 
75 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.686519 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6300  hypothetical protein  84.81 
 
 
102 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  48.68 
 
 
76 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  47.44 
 
 
78 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  45.33 
 
 
79 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  41.03 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1996  prevent-host-death family protein  42.11 
 
 
75 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.374935  normal  0.0428431 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  38.36 
 
 
76 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4044  prevent-host-death protein  38.46 
 
 
78 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.104043  normal  0.215101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4538  prevent-host-death family protein  38.46 
 
 
82 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5378  prevent-host-death family protein  35.71 
 
 
64 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4651  hypothetical protein  34.38 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4124  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167501  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3677  prevent-host-death family protein  36.36 
 
 
81 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763489  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2910  prevent-host-death family protein  39.47 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.293709  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1429  prevent-host-death family protein  34.62 
 
 
81 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0206  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581637  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4033  hypothetical protein  31.51 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.69102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4005  prevent-host-death protein  34.62 
 
 
78 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000530556  hitchhiker  0.00000000252011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1948  prevent-host-death family protein  47.89 
 
 
78 aa  42.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.861466  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0024  prevent-host-death protein  39.71 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  36.36 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1573  prevent-host-death family protein  36.25 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0065  prevent-host-death family protein  39.71 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0046  prevent-host-death family protein  39.71 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.41963  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4693  prevent-host-death family protein  28.75 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.490167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0766  prevent-host-death protein  33.78 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27663  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2530  prevent-host-death family protein  29.87 
 
 
80 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2599  prevent-host-death family protein  32.86 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143583  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  32.5 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>