78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1597 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 73 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  64.38 
 
 		 79 aa  85.1  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3329  prevent-host-death family protein  64.38 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0206  prevent-host-death family protein  56.76 
 
 		 76 aa  76.6  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581637  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3631  prevent-host-death family protein  52.11 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  45.95 
 
 		 76 aa  70.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2939  prevent-host-death family protein  54.05 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100426  normal  0.275009 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  45.33 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  47.37 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3716  prevent-host-death family protein  46.67 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326037 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2910  prevent-host-death family protein  42.67 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.293709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  53.85 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4693  prevent-host-death family protein  41.94 
 
 		 80 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.490167 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0775  prevent-host-death protein  44.62 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99719  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4538  prevent-host-death family protein  44.74 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0994  prevent-host-death protein  38.36 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1429  prevent-host-death family protein  40.26 
 
 		 81 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3677  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763489  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  46.77 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  38.57 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  44.59 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2599  prevent-host-death family protein  39.44 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143583  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4124  prevent-host-death family protein  57.63 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167501  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2423  prevent-host-death protein  38.46 
 
 		 82 aa  50.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  38.67 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0065  prevent-host-death family protein  41.03 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0024  prevent-host-death protein  41.03 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0046  prevent-host-death family protein  41.03 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.41963  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  41.89 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5349  prevent-host-death family protein  41.18 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1566  prevent-host-death family protein  38.16 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.814372 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1315  prevent-host-death family protein  49.09 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147155  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3784  hypothetical protein  60 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640007  decreased coverage  0.000191951 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3738  prevent-host-death family protein  48.94 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0766  prevent-host-death protein  40.85 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27663  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2647  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2223  prevent-host-death family protein  45.83 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2443  prevent-host-death family protein  36.62 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0810105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3369  prevent-host-death family protein  44.07 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0934085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3368  prevent-host-death family protein  38.27 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0414  prevent host death protein  38.46 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0577  prevent-host-death family protein  38.46 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2530  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0707  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1037  prevent-host-death family protein  40.62 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1093  prevent-host-death family protein  38.24 
 
 		 74 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245434  unclonable  0.0000000090615 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3825  prevent-host-death protein  50 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0629  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.285054  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0655  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4005  prevent-host-death protein  34.21 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000530556  hitchhiker  0.00000000252011 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2996  prevent-host-death family protein  32.53 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206214  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1066  prevent-host-death family protein  55 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1572  prevent host death protein  43.86 
 
 		 80 aa  43.5  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677398  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6159  prevent-host-death family protein  33.8 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3011  prevent-host-death family protein  51.22 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2929  prevent-host-death family protein  48.94 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.106644 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3054  prevent-host-death family protein  55.77 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.326995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  44.9 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3050  prevent-host-death family protein  46.94 
 
 		 80 aa  42.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2735  prevent-host-death family protein  32.53 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5378  prevent-host-death family protein  39.06 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963401 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  53.33 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3775  prevent-host-death family protein  58.33 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2596  prevent-host-death family protein  53.66 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00390  hypothetical protein  52.08 
 
 		 49 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.059073 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0199  prevent-host-death family protein  42.65 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172056  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2983  prevent-host-death family protein  53.66 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.413921  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3686  prevent-host-death family protein  38.24 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4044  prevent-host-death protein  32.89 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.104043  normal  0.215101 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1782  prevent-host-death family protein  40.43 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2184  prevent-host-death family protein  34.38 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.415142  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1996  prevent-host-death family protein  40.58 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.374935  normal  0.0428431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2762  prevent-host-death family protein  40.68 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.954217  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2038  prevent-host-death family protein  53.85 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0735  prevent-host-death family protein  48.94 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6300  hypothetical protein  44 
 
 		 102 aa  40.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0108  prevent-host-death family protein  43.9 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>