39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0707 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0707  prevent-host-death family protein  100 
 
 
89 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0629  prevent-host-death family protein  94.38 
 
 
89 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.285054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3825  prevent-host-death protein  92.13 
 
 
89 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0655  prevent-host-death family protein  92.13 
 
 
89 aa  167  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2647  prevent-host-death family protein  89.89 
 
 
89 aa  159  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  52.27 
 
 
82 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1572  prevent host death protein  51.39 
 
 
80 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677398  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0577  prevent-host-death family protein  46.58 
 
 
81 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0414  prevent host death protein  46.58 
 
 
81 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  53.19 
 
 
78 aa  52  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  54.55 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2423  prevent-host-death protein  38.75 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  39.02 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  35.8 
 
 
79 aa  48.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2599  prevent-host-death family protein  39.24 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143583  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0065  prevent-host-death family protein  38.64 
 
 
82 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0046  prevent-host-death family protein  38.64 
 
 
82 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.41963  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0024  prevent-host-death protein  38.64 
 
 
82 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3368  prevent-host-death family protein  41.25 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  46.94 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5349  prevent-host-death family protein  40 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  44.9 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  50 
 
 
73 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3329  prevent-host-death family protein  46.15 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  43.24 
 
 
79 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 
76 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2929  prevent-host-death family protein  46.81 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.106644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2443  prevent-host-death family protein  55.26 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0810105  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2735  prevent-host-death family protein  36.05 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11987  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2996  prevent-host-death family protein  36.05 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206214  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  32.94 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3369  prevent-host-death family protein  47.62 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0934085  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  39.06 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  35.9 
 
 
78 aa  41.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1566  prevent-host-death family protein  35.63 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.814372 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2038  prevent-host-death family protein  51.22 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3631  prevent-host-death family protein  43.75 
 
 
75 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1816  prevent-host-death family protein  39.29 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00000021208  hitchhiker  0.0000000000223341 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4693  prevent-host-death family protein  32.53 
 
 
80 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.490167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>