40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1710 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  100 
 
 
90 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3527  prevent-host-death family protein  85.37 
 
 
82 aa  142  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378115  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0575  prevent-host-death protein  50 
 
 
80 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103149  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3345  prevent-host-death protein  40.96 
 
 
92 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408445  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3078  prevent-host-death protein  40.24 
 
 
80 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.018345  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2038  prevent-host-death family protein  46.55 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0090  prevent-host-death protein  41.46 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3378  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185106  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0140  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  56.1 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2929  prevent-host-death family protein  60.98 
 
 
80 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.106644 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1844  prevent-host-death family protein  37.18 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0061  prevent-host-death family protein  50 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933415  normal  0.536193 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5883  prevent-host-death family protein  50 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.635627 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2085  prevent-host-death family protein  35.37 
 
 
86 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2469  prevent-host-death family protein  37.1 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117875  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  50 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4551  prevent-host-death family protein  53.66 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  40 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2645  prevent-host-death family protein  38.57 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1777  prevent-host-death family protein  51.22 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  39.02 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1212  prevent-host-death family protein  35 
 
 
101 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.376618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1318  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 
80 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.404403  normal  0.571647 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0775  prevent-host-death protein  44.44 
 
 
79 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99719  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  42.31 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  34.72 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  41.03 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2762  prevent-host-death family protein  51.22 
 
 
82 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.954217  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3713  prevent-host-death family protein  43.86 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313781  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0065  prevent-host-death family protein  43.14 
 
 
82 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5349  prevent-host-death family protein  40.32 
 
 
75 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0046  prevent-host-death family protein  43.14 
 
 
82 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.41963  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0024  prevent-host-death protein  43.14 
 
 
82 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1315  prevent-host-death family protein  47.5 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147155  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1545  prevent-host-death family protein  55.26 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0610956  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0994  prevent-host-death protein  45.45 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3886  prevent-host-death family protein  46.15 
 
 
83 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2423  prevent-host-death protein  32.35 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  32.56 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>