26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2085 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2085  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 86 aa  175  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  55.81 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  53.49 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0090  prevent-host-death protein  50 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3345  prevent-host-death protein  44.3 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4105  hypothetical protein  43.21 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1212  prevent-host-death family protein  45.16 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.376618 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2538  prevent-host-death family protein  44.19 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.91328 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3078  prevent-host-death protein  44.16 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.018345  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1822  prevent-host-death family protein  38.55 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  52.17 
 
 		 93 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0140  prevent-host-death family protein  44.12 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3378  prevent-host-death family protein  41.33 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185106  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6276  prevent-host-death family protein  43.48 
 
 		 84 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4711  prevent-host-death family protein  48 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4514  prevent-host-death protein  37.93 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.680635  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  42.42 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5883  prevent-host-death family protein  41.18 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.635627 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0872  hypothetical protein  38.82 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.653193  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2530  prevent-host-death protein  40.32 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2874  prevent-host-death family protein  40.32 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2535  prevent-host-death protein  37.5 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.784194  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  35.37 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0012  prevent-host-death protein  45.83 
 
 		 102 aa  42.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  42.22 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3527  prevent-host-death family protein  35.37 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378115  normal  0.865399 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>