25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6276 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6276  prevent-host-death family protein  100 
 
 
84 aa  169  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2538  prevent-host-death family protein  79.76 
 
 
84 aa  137  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.91328 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1822  prevent-host-death family protein  47.46 
 
 
81 aa  62  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307814  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0012  prevent-host-death protein  39.02 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  42.62 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  42.42 
 
 
93 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4711  prevent-host-death family protein  44.78 
 
 
86 aa  57.4  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  47.54 
 
 
94 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0872  hypothetical protein  39.02 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.653193  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1595  prevent-host-death family protein  48 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  43.59 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1697  prevent-host-death family protein  38.82 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000276102  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  42.31 
 
 
85 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1212  prevent-host-death family protein  42.22 
 
 
101 aa  50.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.376618 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2085  prevent-host-death family protein  43.48 
 
 
86 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2874  prevent-host-death family protein  40.98 
 
 
85 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  34.33 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4514  prevent-host-death protein  42.37 
 
 
91 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.680635  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2535  prevent-host-death protein  42.11 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.784194  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4105  hypothetical protein  37.21 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5092  prevent-host-death family protein  36.59 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  42.37 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1401  prevent-host-death family protein  36.59 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.489676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3961  prevent-host-death family protein  35.09 
 
 
86 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.986483  normal  0.184191 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0090  prevent-host-death protein  34.94 
 
 
80 aa  41.2  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>