34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0623 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  100 
 
 		 94 aa  191  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0012  prevent-host-death protein  51.81 
 
 		 102 aa  88.2  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  40.96 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  43.9 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4711  prevent-host-death family protein  41.86 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0872  hypothetical protein  39.76 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.653193  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1822  prevent-host-death family protein  41.46 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1212  prevent-host-death family protein  46.05 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.376618 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1595  prevent-host-death family protein  38.67 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  43.21 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1697  prevent-host-death family protein  41.33 
 
 		 82 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000276102  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6276  prevent-host-death family protein  47.54 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4580  prevent-host-death family protein  37.08 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5263  prevent-host-death family protein  38.04 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4537  prevent-host-death family protein  39.13 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0623765 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2538  prevent-host-death family protein  45.9 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.91328 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  42.47 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2874  prevent-host-death family protein  37.04 
 
 		 85 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4105  hypothetical protein  45.71 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  41.25 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5883  prevent-host-death family protein  40.91 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.635627 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1401  prevent-host-death family protein  35.29 
 
 		 86 aa  50.4  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.489676 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3421  prevent-host-death family protein  36.71 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.985918 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4514  prevent-host-death protein  36.36 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.680635  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4285  hypothetical protein  35.71 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192464  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0090  prevent-host-death protein  46.97 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5092  prevent-host-death family protein  34.15 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2535  prevent-host-death protein  37.7 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.784194  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2085  prevent-host-death family protein  42.42 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3078  prevent-host-death protein  39.39 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.018345  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0140  prevent-host-death family protein  39.34 
 
 		 83 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3345  prevent-host-death protein  39.39 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3378  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185106  normal  0.561941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>