37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4285 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4285  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  185  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192464  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4580  prevent-host-death family protein  80.77 
 
 		 88 aa  130  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5263  prevent-host-death family protein  75.9 
 
 		 88 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5092  prevent-host-death family protein  75.29 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4537  prevent-host-death family protein  80 
 
 		 88 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0623765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  73.08 
 
 		 93 aa  123  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4514  prevent-host-death protein  62.65 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.680635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  41.94 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  37.04 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  41.46 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1595  prevent-host-death family protein  43.06 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0872  hypothetical protein  40 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.653193  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1697  prevent-host-death family protein  42.67 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000276102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0012  prevent-host-death protein  39.24 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5883  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.635627 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1822  prevent-host-death family protein  37.97 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4711  prevent-host-death family protein  43.75 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  35.71 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  37.35 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0164  prevent-host-death family protein  35.56 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0094  prevent-host-death family protein  32.22 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0090  prevent-host-death protein  45 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0096  prevent-host-death family protein  35.38 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3421  prevent-host-death family protein  39.74 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.985918 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2734  prevent-host-death protein  42.55 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.431133  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1162  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203241  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3378  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 		 83 aa  42.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185106  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0856  prevent-host-death protein  34.78 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162182 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1770  prevent-host-death family protein  27.27 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3078  prevent-host-death protein  43.33 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.018345  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3345  prevent-host-death protein  41.67 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2874  prevent-host-death family protein  37.14 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1544  prevent-host-death family protein  34.15 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1496  prevent-host-death family protein  34.15 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0844897  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0140  prevent-host-death family protein  42.59 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2530  prevent-host-death protein  45.45 
 
 		 69 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>