19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0164 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0164  prevent-host-death family protein  100 
 
 
87 aa  170  6.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1162  prevent-host-death family protein  56.96 
 
 
84 aa  102  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203241  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1544  prevent-host-death family protein  52.78 
 
 
87 aa  85.1  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1496  prevent-host-death family protein  52.78 
 
 
87 aa  85.1  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0844897  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1770  prevent-host-death family protein  47.83 
 
 
84 aa  67.8  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  45.24 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4537  prevent-host-death family protein  38.64 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0623765 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4285  hypothetical protein  35.56 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192464  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4580  prevent-host-death family protein  38.1 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  41.86 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  41.86 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5092  prevent-host-death family protein  34.78 
 
 
112 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4514  prevent-host-death protein  33.33 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.680635  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10272  hypothetical protein  28.07 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.102894 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5263  prevent-host-death family protein  35.71 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416232  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2906  prevent-host-death family protein  23.94 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1941  prevent-host-death family protein  36.23 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1300  prevent-host-death family protein  27.27 
 
 
89 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4669  prevent-host-death family protein  40 
 
 
86 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>