55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0506 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4580  prevent-host-death family protein  70.45 
 
 		 88 aa  127  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4285  hypothetical protein  73.08 
 
 		 92 aa  123  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192464  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4537  prevent-host-death family protein  70.59 
 
 		 88 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0623765 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5263  prevent-host-death family protein  72.15 
 
 		 88 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4514  prevent-host-death protein  66.25 
 
 		 91 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.680635  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5092  prevent-host-death family protein  66.28 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  48.91 
 
 		 93 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  40.51 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1822  prevent-host-death family protein  46.84 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4711  prevent-host-death family protein  50.77 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0012  prevent-host-death protein  44.3 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  40 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1595  prevent-host-death family protein  45.21 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  43.21 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  38.82 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1212  prevent-host-death family protein  40.78 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.376618 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1697  prevent-host-death family protein  42.67 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000276102  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4105  hypothetical protein  38.55 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0872  hypothetical protein  37.04 
 
 		 83 aa  52  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.653193  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5883  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.635627 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3378  prevent-host-death family protein  48.61 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185106  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0094  prevent-host-death family protein  38.16 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0096  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0164  prevent-host-death family protein  45.24 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0140  prevent-host-death family protein  47.22 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  36.59 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0856  prevent-host-death protein  38.71 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3078  prevent-host-death protein  41.56 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.018345  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1496  prevent-host-death family protein  37.29 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0844897  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2874  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1544  prevent-host-death family protein  37.29 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6403  prevent-host-death family protein  38.98 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2530  prevent-host-death protein  54.55 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3345  prevent-host-death protein  44.93 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0090  prevent-host-death protein  44.16 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2838  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  37.1 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2538  prevent-host-death family protein  44.07 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.91328 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6276  prevent-host-death family protein  42.37 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3421  prevent-host-death family protein  35.9 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.985918 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4748  prevent-host-death family protein  40.62 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2535  prevent-host-death protein  35.9 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.784194  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3797  hypothetical protein  41.46 
 
 		 62 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.731882  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0087  hypothetical protein  42.55 
 
 		 86 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.701253  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4183  prevent-host-death family protein  33.9 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3332  prevent-host-death family protein  33.9 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4834  prevent-host-death protein  33.9 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  41.03 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2929  prevent-host-death family protein  62.16 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.106644 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1162  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203241  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1770  prevent-host-death family protein  38.1 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3961  prevent-host-death family protein  34.57 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.986483  normal  0.184191 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4551  prevent-host-death family protein  62.86 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2734  prevent-host-death protein  39.13 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.431133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1398  prevent-host-death protein  34.38 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000552263  normal  0.0192165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>