24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0087 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0087  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  174  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.701253  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4559  prevent-host-death family protein  93.02 
 
 		 86 aa  163  9e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3472  prevent-host-death family protein  93.02 
 
 		 86 aa  163  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0190  prevent-host-death family protein  91.86 
 
 		 86 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1991  prevent-host-death family protein  91.86 
 
 		 86 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4669  prevent-host-death family protein  68.6 
 
 		 86 aa  123  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08246  prevent-host-death family protein  53.49 
 
 		 86 aa  103  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0429  prevent-host-death family protein  47.5 
 
 		 80 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0333  prevent-host-death family protein  46.25 
 
 		 80 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3693  prevent-host-death family protein  46.25 
 
 		 80 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0936  hypothetical protein  45 
 
 		 80 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00200085  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2802  prevent-host-death protein  42.5 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3797  hypothetical protein  45.65 
 
 		 62 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.731882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0546  prevent-host-death family protein  39.71 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241821  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2136  prevent-host-death family protein  43.48 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.732701 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02236  Antitoxin of toxin-antitoxin system Phd  38.57 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.934287  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3569  prevent-host-death family protein  38.3 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5521  prevent-host-death family protein  32.53 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133668  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4537  prevent-host-death family protein  40.43 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0623765 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4580  prevent-host-death family protein  47.22 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  42.55 
 
 		 93 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  34.69 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  34.69 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5263  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416232  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>