21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0936 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0936  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  165  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00200085  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0333  prevent-host-death family protein  73.75 
 
 		 80 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3693  prevent-host-death family protein  73.75 
 
 		 80 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0429  prevent-host-death family protein  72.5 
 
 		 80 aa  124  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08246  prevent-host-death family protein  53.75 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0087  hypothetical protein  45 
 
 		 86 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.701253  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4669  prevent-host-death family protein  42.5 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3472  prevent-host-death family protein  43.75 
 
 		 86 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4559  prevent-host-death family protein  43.75 
 
 		 86 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0190  prevent-host-death family protein  43.75 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1991  prevent-host-death family protein  43.75 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2802  prevent-host-death protein  38.27 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02236  Antitoxin of toxin-antitoxin system Phd  35.29 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.934287  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0546  prevent-host-death family protein  45.65 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241821  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3569  prevent-host-death family protein  38.3 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3797  hypothetical protein  34.78 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.731882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5521  prevent-host-death family protein  41.18 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133668  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1066  prevent-host-death family protein  30.14 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4513  prevent-host-death protein  43.18 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.475563  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5550  prevent-host-death family protein  30.88 
 
 		 84 aa  42  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0473794 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2136  prevent-host-death family protein  32.61 
 
 		 62 aa  40.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.732701 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>