26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5550 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5550  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 84 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0473794 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4379  prevent-host-death family protein  57.14 
 
 		 86 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.355289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5007  prevent-host-death family protein  66.15 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6509  prevent-host-death family protein  52.38 
 
 		 86 aa  90.1  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104787  normal  0.482695 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6194  prevent-host-death family protein  62.9 
 
 		 86 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00572881  normal  0.0262754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5128  prevent-host-death family protein  46.38 
 
 		 86 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4991  prevent-host-death family protein  40.26 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4743  prevent-host-death family protein  46.15 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6483  prevent-host-death family protein  40.28 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.293864  normal  0.643731 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4112  prevent-host-death family protein  44 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0108823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2649  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2838  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  45.65 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5576  hypothetical protein  42.55 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0185391  normal  0.187138 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6498  prevent-host-death family protein  38.27 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756783 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5802  prevent-host-death family protein  35.8 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226627  hitchhiker  0.00969528 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4109  hypothetical protein  41.67 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3693  prevent-host-death family protein  30.88 
 
 		 80 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4023  prevent-host-death family protein  43.33 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0333  prevent-host-death family protein  30.88 
 
 		 80 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0936  hypothetical protein  30.88 
 
 		 80 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00200085  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4513  prevent-host-death protein  46.34 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.475563  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5328  prevent-host-death family protein  38.71 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0497  putative prevent-host-death protein  38.71 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0856  prevent-host-death protein  39.58 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162182 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4564  prevent-host-death family protein  36.96 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0429  prevent-host-death family protein  29.41 
 
 		 80 aa  40  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>