18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4112 on replicon NC_009958
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009958  Dshi_4112  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 75 aa  150  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0108823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4513  prevent-host-death protein  54.55 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.475563  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3750  prevent-host-death family protein  51.11 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.208699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2649  prevent-host-death family protein  52.63 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4379  prevent-host-death family protein  43.75 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.355289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5802  prevent-host-death family protein  54.55 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226627  hitchhiker  0.00969528 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0497  putative prevent-host-death protein  53.49 
 
 		 87 aa  49.7  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6498  prevent-host-death family protein  52.27 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756783 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5328  prevent-host-death family protein  53.49 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6194  prevent-host-death family protein  42.55 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00572881  normal  0.0262754 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6509  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104787  normal  0.482695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5128  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0421  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5550  prevent-host-death family protein  44 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0473794 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5354  prevent-host-death family protein  48.84 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.250288 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1103  putative PAS/PAC sensor protein  32.86 
 
 		 298 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0429  prevent-host-death family protein  39.22 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1066  prevent-host-death family protein  35.53 
 
 		 82 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>