27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4513 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4513  prevent-host-death protein  100 
 
 		 91 aa  184  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.475563  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5328  prevent-host-death family protein  68.13 
 
 		 91 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6498  prevent-host-death family protein  69.57 
 
 		 92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756783 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5802  prevent-host-death family protein  69.57 
 
 		 92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226627  hitchhiker  0.00969528 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0497  putative prevent-host-death protein  68.75 
 
 		 87 aa  116  9e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1800  prevent-host-death protein  42.67 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1598  prevent-host-death family protein  45.21 
 
 		 83 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5354  prevent-host-death family protein  38.1 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.250288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0421  hypothetical protein  45.31 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4112  prevent-host-death family protein  54.55 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0108823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2649  prevent-host-death family protein  42.11 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3750  prevent-host-death family protein  33.82 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.208699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4379  prevent-host-death family protein  44.07 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.355289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6509  prevent-host-death family protein  41.86 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104787  normal  0.482695 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2838  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  43.4 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6194  prevent-host-death family protein  41.86 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00572881  normal  0.0262754 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3797  hypothetical protein  45.65 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.731882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0936  hypothetical protein  43.18 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00200085  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5128  prevent-host-death family protein  43.14 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0856  prevent-host-death protein  35.71 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162182 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4564  prevent-host-death family protein  39.13 
 
 		 84 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5550  prevent-host-death family protein  46.34 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0473794 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5521  prevent-host-death family protein  45.95 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133668  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6483  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.293864  normal  0.643731 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4748  prevent-host-death family protein  34 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0546  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241821  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2136  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 		 62 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.732701 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>