25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6498 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009622  Smed_6498  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 92 aa  187  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756783 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5802  prevent-host-death family protein  97.83 
 
 		 92 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226627  hitchhiker  0.00969528 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5328  prevent-host-death family protein  73.91 
 
 		 91 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0497  putative prevent-host-death protein  76.19 
 
 		 87 aa  133  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4513  prevent-host-death protein  69.57 
 
 		 91 aa  114  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.475563  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1598  prevent-host-death family protein  39.73 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1800  prevent-host-death protein  36 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0421  hypothetical protein  45.31 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5354  prevent-host-death family protein  37.04 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.250288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3750  prevent-host-death family protein  38.24 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.208699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4379  prevent-host-death family protein  32.5 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.355289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4112  prevent-host-death family protein  52.27 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0108823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6509  prevent-host-death family protein  46.51 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104787  normal  0.482695 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2649  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6194  prevent-host-death family protein  44.19 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00572881  normal  0.0262754 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3797  hypothetical protein  43.48 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.731882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5550  prevent-host-death family protein  38.27 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0473794 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5707  prevent-host-death family protein  32.18 
 
 		 90 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4991  prevent-host-death family protein  38.03 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2838  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  33.82 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6483  prevent-host-death family protein  40.68 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.293864  normal  0.643731 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5007  prevent-host-death family protein  31.88 
 
 		 86 aa  40.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3569  prevent-host-death family protein  51.43 
 
 		 74 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5128  prevent-host-death family protein  33.82 
 
 		 86 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4337  prevent-host-death protein  43.18 
 
 		 77 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>