29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4337 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4337  prevent-host-death protein  100 
 
 		 77 aa  155  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3417  prevent-host-death protein  53.85 
 
 		 83 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531157  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4564  prevent-host-death family protein  53.85 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2000  prevent-host-death family protein  52.56 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0919472  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3332  prevent-host-death family protein  47.44 
 
 		 83 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4183  prevent-host-death family protein  47.44 
 
 		 83 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4834  prevent-host-death protein  47.44 
 
 		 83 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2838  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  52.56 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1398  prevent-host-death protein  53.16 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000552263  normal  0.0192165 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0680  prevent-host-death protein  51.28 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219164  normal  0.89049 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4748  prevent-host-death family protein  54.43 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0856  prevent-host-death protein  48.72 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3164  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 84 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2040  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 84 aa  72  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6403  prevent-host-death family protein  53.12 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3557  prevent-host-death family protein  47.37 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5182  prevent-host-death family protein  40.48 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0096  prevent-host-death family protein  47.06 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0094  prevent-host-death family protein  46.38 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1389  prevent-host-death family protein  42.31 
 
 		 85 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4109  hypothetical protein  41.67 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  39.47 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1103  putative PAS/PAC sensor protein  44.68 
 
 		 298 aa  43.5  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  36.76 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5576  hypothetical protein  38.78 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0185391  normal  0.187138 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0497  putative prevent-host-death protein  44.19 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5883  prevent-host-death family protein  48.89 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.635627 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0872  hypothetical protein  55.26 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.653193  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6498  prevent-host-death family protein  43.18 
 
 		 92 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>