20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2000 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2000  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 83 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0919472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3417  prevent-host-death protein  90.36 
 
 		 83 aa  154  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531157  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0680  prevent-host-death protein  72.84 
 
 		 84 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219164  normal  0.89049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3164  prevent-host-death family protein  66.67 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4834  prevent-host-death protein  61.25 
 
 		 83 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3332  prevent-host-death family protein  61.25 
 
 		 83 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4183  prevent-host-death family protein  61.25 
 
 		 83 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2040  prevent-host-death family protein  62.96 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1398  prevent-host-death protein  61.73 
 
 		 93 aa  97.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000552263  normal  0.0192165 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0856  prevent-host-death protein  55.56 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162182 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4564  prevent-host-death family protein  58.02 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2838  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  51.22 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1389  prevent-host-death family protein  53.66 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0096  prevent-host-death family protein  58.44 
 
 		 80 aa  83.6  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6403  prevent-host-death family protein  53.66 
 
 		 84 aa  83.6  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0094  prevent-host-death family protein  58.44 
 
 		 102 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4748  prevent-host-death family protein  53.09 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4337  prevent-host-death protein  52.56 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3557  prevent-host-death family protein  55.07 
 
 		 83 aa  80.5  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5182  prevent-host-death family protein  48.78 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104067  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>