17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4109 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4109  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  174  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5128  prevent-host-death family protein  35.06 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6194  prevent-host-death family protein  36.49 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00572881  normal  0.0262754 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4379  prevent-host-death family protein  34.62 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.355289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5576  hypothetical protein  47.83 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0185391  normal  0.187138 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4991  prevent-host-death family protein  39.62 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6483  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.293864  normal  0.643731 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5007  prevent-host-death family protein  30.67 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6509  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104787  normal  0.482695 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4743  prevent-host-death family protein  45.1 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4337  prevent-host-death protein  41.67 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2838  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  61.29 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0856  prevent-host-death protein  58.82 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162182 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4564  prevent-host-death family protein  52.63 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5550  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0473794 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1398  prevent-host-death protein  40.91 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000552263  normal  0.0192165 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0096  prevent-host-death family protein  41.86 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>