39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2340 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  100 
 
 
82 aa  169  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  48.1 
 
 
93 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1595  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 
77 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0012  prevent-host-death protein  42.68 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4711  prevent-host-death family protein  46.15 
 
 
86 aa  71.6  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1697  prevent-host-death family protein  41.25 
 
 
82 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000276102  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0872  hypothetical protein  43.37 
 
 
83 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.653193  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  40.96 
 
 
94 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4537  prevent-host-death family protein  39.51 
 
 
88 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0623765 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1822  prevent-host-death family protein  41.46 
 
 
81 aa  67  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307814  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  40.51 
 
 
93 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5263  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416232  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4580  prevent-host-death family protein  37.97 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4285  hypothetical protein  37.04 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192464  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5092  prevent-host-death family protein  39.19 
 
 
112 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6276  prevent-host-death family protein  42.62 
 
 
84 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4514  prevent-host-death protein  34.18 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.680635  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3421  prevent-host-death family protein  35.9 
 
 
83 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.985918 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  32.91 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2538  prevent-host-death family protein  40.68 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.91328 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  35.71 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3961  prevent-host-death family protein  36.67 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.986483  normal  0.184191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  42.22 
 
 
85 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4105  hypothetical protein  31.65 
 
 
80 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5883  prevent-host-death family protein  32.93 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.635627 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2874  prevent-host-death family protein  36.17 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0575  prevent-host-death protein  35.37 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103149  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2535  prevent-host-death protein  34.04 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.784194  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1401  prevent-host-death family protein  35.8 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.489676 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3078  prevent-host-death protein  46.81 
 
 
80 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.018345  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1212  prevent-host-death family protein  43.48 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.376618 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0140  prevent-host-death family protein  38.78 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0090  prevent-host-death protein  36.84 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2838  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  33.33 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3345  prevent-host-death protein  39.68 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408445  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4337  prevent-host-death protein  36.76 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2734  prevent-host-death protein  51.35 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.431133  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  32.56 
 
 
90 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3378  prevent-host-death family protein  38.78 
 
 
83 aa  40  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185106  normal  0.561941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>