12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2734 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2734  prevent-host-death protein  100 
 
 		 98 aa  197  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.431133  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  43.75 
 
 		 83 aa  53.5  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1162  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203241  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  46.34 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  43.9 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4434  prevent-host-death protein  38.46 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0804206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4285  hypothetical protein  42.55 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192464  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4711  prevent-host-death family protein  35.63 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5092  prevent-host-death family protein  43.48 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0872  hypothetical protein  53.85 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.653193  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  39.13 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  51.35 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>