31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4711 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4711  prevent-host-death family protein  100 
 
 
86 aa  177  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0872  hypothetical protein  67.44 
 
 
83 aa  120  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.653193  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0012  prevent-host-death protein  53.85 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  46.15 
 
 
82 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  41.86 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  50.77 
 
 
93 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  48.44 
 
 
93 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1595  prevent-host-death family protein  43.94 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1697  prevent-host-death family protein  43.94 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000276102  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4537  prevent-host-death family protein  43.24 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0623765 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6276  prevent-host-death family protein  44.78 
 
 
84 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1822  prevent-host-death family protein  41.94 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307814  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1401  prevent-host-death family protein  50.82 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.489676 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5092  prevent-host-death family protein  43.75 
 
 
112 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2538  prevent-host-death family protein  45.76 
 
 
84 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.91328 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  40 
 
 
83 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5263  prevent-host-death family protein  40.54 
 
 
88 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416232  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4580  prevent-host-death family protein  39.76 
 
 
88 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4285  hypothetical protein  43.75 
 
 
92 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192464  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4514  prevent-host-death protein  38.27 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.680635  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3421  prevent-host-death family protein  36.9 
 
 
83 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.985918 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2085  prevent-host-death family protein  48 
 
 
86 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  38.96 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  38.96 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1212  prevent-host-death family protein  37.33 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.376618 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5883  prevent-host-death family protein  40.3 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.635627 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2874  prevent-host-death family protein  38.98 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2535  prevent-host-death protein  42.55 
 
 
85 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.784194  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0090  prevent-host-death protein  41.79 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2734  prevent-host-death protein  35.63 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.431133  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3078  prevent-host-death protein  38.37 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.018345  normal  0.547068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>