23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1212 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1212  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 101 aa  202  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.376618 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4105  hypothetical protein  40.91 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  46.05 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2085  prevent-host-death family protein  45.16 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1822  prevent-host-death family protein  38.2 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  42.7 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  40.78 
 
 		 93 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  41.57 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2538  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.91328 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6276  prevent-host-death family protein  42.22 
 
 		 84 aa  50.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  47.73 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4711  prevent-host-death family protein  37.33 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4537  prevent-host-death family protein  34.83 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0623765 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3345  prevent-host-death protein  37.5 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0090  prevent-host-death protein  41.79 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3078  prevent-host-death protein  36.9 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.018345  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0012  prevent-host-death protein  41.3 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5263  prevent-host-death family protein  32.58 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0140  prevent-host-death family protein  36.23 
 
 		 83 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5883  prevent-host-death family protein  42.22 
 
 		 79 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.635627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  35 
 
 		 90 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4514  prevent-host-death protein  30.21 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.680635  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  43.48 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>