22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3345 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3345  prevent-host-death protein  100 
 
 		 92 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3078  prevent-host-death protein  90 
 
 		 80 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.018345  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0090  prevent-host-death protein  82.05 
 
 		 80 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5883  prevent-host-death family protein  72.06 
 
 		 79 aa  104  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.635627 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0140  prevent-host-death family protein  60.53 
 
 		 83 aa  100  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3378  prevent-host-death family protein  59.21 
 
 		 83 aa  97.8  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185106  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2530  prevent-host-death protein  58.06 
 
 		 69 aa  77  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2085  prevent-host-death family protein  44.3 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  40.96 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0575  prevent-host-death protein  43.59 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103149  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3527  prevent-host-death family protein  53.33 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378115  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  40.3 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  44.93 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  37.18 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1212  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.376618 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4285  hypothetical protein  41.67 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192464  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3930  Axe family addiction module antitoxin  39.13 
 
 		 73 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5092  prevent-host-death family protein  39.73 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  33.75 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  39.39 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  39.68 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>