24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3930 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3930  Axe family addiction module antitoxin  100 
 
 		 73 aa  149  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3828  addiction module antitoxin  97.26 
 
 		 73 aa  146  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.899294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1858  prevent-host-death family protein  53.42 
 
 		 73 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4125  prevent-host-death family protein  50.68 
 
 		 73 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00268553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  37.31 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0140  prevent-host-death family protein  34.25 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3378  prevent-host-death family protein  35.38 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185106  normal  0.561941 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1639  prevent-host-death family protein  46.67 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0329629  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1214  antitoxin YefM  46.67 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2309  antitoxin YefM  46.67 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.516264  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2156  antitoxin YefM  46.67 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1697  prevent-host-death family protein  38.18 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000276102  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5998  prevent-host-death protein:addiction module toxin, Txe/YoeB  40.98 
 
 		 106 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01350  prevent-host-death family protein  47.83 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0351  prevent-host-death family protein  39.13 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3961  prevent-host-death family protein  34 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.986483  normal  0.184191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3078  prevent-host-death protein  39.13 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.018345  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1595  prevent-host-death family protein  35.29 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3345  prevent-host-death protein  39.13 
 
 		 92 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0090  prevent-host-death protein  40.43 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0989  prevent-host-death family protein  43.48 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5458  prevent-host-death family protein  45.65 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4765  prevent-host-death family protein  45.65 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2535  prevent-host-death protein  28.57 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.784194  normal  0.833179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>