24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2535 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2535  prevent-host-death protein  100 
 
 
85 aa  169  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.784194  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2874  prevent-host-death family protein  72.62 
 
 
85 aa  124  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3961  prevent-host-death family protein  58.54 
 
 
86 aa  100  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.986483  normal  0.184191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1822  prevent-host-death family protein  52.24 
 
 
81 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307814  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3421  prevent-host-death family protein  47.54 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.985918 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  45.07 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  45.12 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0012  prevent-host-death protein  51.06 
 
 
102 aa  50.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2538  prevent-host-death family protein  44.83 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.91328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  47.73 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  37.7 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6276  prevent-host-death family protein  42.11 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  41.82 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4711  prevent-host-death family protein  42.55 
 
 
86 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2085  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 
86 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4514  prevent-host-death protein  40 
 
 
91 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.680635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  35.9 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1697  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000276102  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  34.04 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1595  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3828  addiction module antitoxin  28.57 
 
 
73 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.899294  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3930  Axe family addiction module antitoxin  28.57 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0090  prevent-host-death protein  34.21 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1401  prevent-host-death family protein  40.58 
 
 
86 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.489676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>